Жоңғар-Алатау мемлекеттік ұлттық табиғи паркі Биоәртүрлілікті (оның ішінде жаһандық маңызы бар жабайы жеміс ормандарының генофондын) және ерекше экологиялық, генетикалық, тарихи және эстетикалық құндылығы бар табиғи таулы ландшафттарды сақтау мақсатында құрылған. Жоңғар-Алатау мемлекеттік ұлттық табиғи паркінің жалпы ауданы 356 022 га құрайды. Әкімшілік жағынан саябақ Алматы облысының үш ауданының - Ақсу, Сарқан және Алакөл аудандарының аумағында орналасқан.Саябақтың орналасқан аймағы-Жетісу Алатауы-өсімдіктердің жабайы жеміс-жидек түрлерінің бай ассортиментімен ерекшеленеді, ол саябақтың аумағында да толық көрінеді: кәдімгі өрік, дөңгелек бөріқарақат, Тяньшань шиесі, Альберта итмұрыны, Мейер қарақаты және т. б. бұл аймақ тау агробиоалуантүрлілігінің шоғырлануының маңызды орталығы болып табылады,оның ішінде Сиверс алма ағашы ерекше орын алады, құнды генетикалық материал болып табылады. Жоңғар - Алатау ұлттық паркінің филиалдары бар: 1.Сарқан, Алматы облысы, Сарқан ауданы, Сарқан қаласы; 2.Лепсі, Алматы облысы, Алакөл ауданы, Лепсі ауылы; 3.Алакөл, Алматы облысы, Алакөл ауданы, Көкжар ауылы. Парк аумағына кіру Жоңғар-Алатау ұлттық паркінің филиалдарынан сатып алу қажет рұқсаттамалар бойынша қатаң түрде жүзеге асырылады.